Dit keer speel jij de arme leerjongen van Manannan en je hebt niet veel tijd meer. Je moet ontsnappen! Wanneer je meester het kasteel verlaat, moet je je verdiepen in zijn spreukenboeken. Om ingrediënten bij elkaar te sprokkelen kun je naar het nabijgelegen dorp. Zorg wel dat je op tijd terug bent, want Manannan is niet vergevingsgezind! Tijdens het spel kom je nog te weten komt wie je echte ouders zijn en dat je een zus hebt (die nota bene in levensgevaar is). Nog een extra reden om uit de klauwen van Manannan te ontsnappen!

KQ3 gebruikt nog steeds dezelfde graphics als de eerdere delen maar deze keer met meer details. De magische kaart (waarmee je kunt teleporteren naar eender waar in het Llewdor) is wel volledig nieuw.